Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbc1d1Q60949 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d1Q60949 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms