Protein–RNA interactions for Protein: Q60930

Vdac2, Voltage-dependent anion-selective channel protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac2Q60930 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vdac2Q60930 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac2Q60930 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac2Q60930 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms