Protein–RNA interactions for Protein: Q60900

Elavl3, ELAV-like protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elavl3Q60900 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elavl3Q60900 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elavl3Q60900 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elavl3Q60900 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms