Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkn2dQ60773 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2dQ60773 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkn2dQ60773 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms