Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn11Q60771 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms