Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stxbp3Q60770 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stxbp3Q60770 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stxbp3Q60770 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp3Q60770 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms