Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyb561Q60720 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyb561Q60720 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyb561Q60720 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms