Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samhd1Q60710 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms