Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A1cfQ5YD48 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A1cfQ5YD48 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A1cfQ5YD48 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A1cfQ5YD48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A1cfQ5YD48 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A1cfQ5YD48 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A1cfQ5YD48 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms