Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp20Q5XG71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp20Q5XG71 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms