Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tdrd5Q5VCS6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tdrd5Q5VCS6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd5Q5VCS6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd5Q5VCS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd5Q5VCS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms