Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gprasp1Q5U4C1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gprasp1Q5U4C1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gprasp1Q5U4C1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms