Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LpoQ5SW46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LpoQ5SW46 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LpoQ5SW46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LpoQ5SW46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms