Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ggnbp2Q5SV77 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ggnbp2Q5SV77 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ggnbp2Q5SV77 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ggnbp2Q5SV77 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms