Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms