Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp18Q5SSI6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms