Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930512M02RikQ5SQK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930512M02RikQ5SQK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms