Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms