Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmprss11eQ5S248 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmprss11eQ5S248 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmprss11eQ5S248 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmprss11eQ5S248 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmprss11eQ5S248 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmprss11eQ5S248 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmprss11eQ5S248 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms