Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpm3Q5F4S9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm3Q5F4S9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm3Q5F4S9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms