Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp22Q5DU02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp22Q5DU02 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms