Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2f8Q58FA4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2f8Q58FA4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f8Q58FA4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms