Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354cQ571J5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf354cQ571J5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf354cQ571J5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms