Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss53Q571E5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss53Q571E5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss53Q571E5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms