Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccnl1Q52KE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccnl1Q52KE7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccnl1Q52KE7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms