Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr4Q501J7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms