Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne3Q4FZC9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syne3Q4FZC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms