Protein–RNA interactions for Protein: Q497P9

Gm5941, MCG112829, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5941Q497P9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5941Q497P9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5941Q497P9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms