Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg1lQ3V384 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg1lQ3V384 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms