Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgadQ3V0T4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgadQ3V0T4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgadQ3V0T4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgadQ3V0T4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms