Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfi1Q3UZY0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfi1Q3UZY0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfi1Q3UZY0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms