Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SvipQ3UZP4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms