Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWM4

Kdm7a, Lysine-specific demethylase 7A, mousemouse

Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm7aQ3UWM4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm7aQ3UWM4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm7aQ3UWM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm7aQ3UWM4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm7aQ3UWM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms