Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn4Q3UV66 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms