Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Eb2Q3UUV9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Eb2Q3UUV9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms