Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29609Q3UU56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm29609Q3UU56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms