Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf48Q3US17 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms