Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TceancQ3US16 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TceancQ3US16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.9 ms