Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Acsf3Q3URE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Acsf3Q3URE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acsf3Q3URE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acsf3Q3URE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms