Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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