Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam198bQ3UPI1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam198bQ3UPI1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam198bQ3UPI1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam198bQ3UPI1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fam198bQ3UPI1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam198bQ3UPI1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam198bQ3UPI1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam198bQ3UPI1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms