Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Uspl1Q3ULM6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uspl1Q3ULM6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uspl1Q3ULM6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uspl1Q3ULM6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms