Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm648Q3UJ22 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm648Q3UJ22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms