Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmed8Q3UHI4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed8Q3UHI4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmed8Q3UHI4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms