Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms