Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trip13Q3UA06 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip13Q3UA06 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip13Q3UA06 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms