Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LbrQ3U9G9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbrQ3U9G9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbrQ3U9G9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms