Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf180Q3U827 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf180Q3U827 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf180Q3U827 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf180Q3U827 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rnf180Q3U827 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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