Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc174Q3U155 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc174Q3U155 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms