Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms